Famille de Jean : On ne sait rien sur sa mère. Son père est mort. Il était capitaine d'un navire qui a sombré en mer. Il vit avec son oncle Henri, avec qui il travaille sur des inventions, et sa tante, qui est plutôt rigide.

Famille de Nadia : Son père est le capitaine Némo. Il l'a abandonné après que sa mère soit morte lors de la destruction de la cité Atlante. Elle a un frère : l'empereur Néo, laissé pour mort mais ranimé par Argon.

Famille de Marie : Ses parents et son chien ont été tués par les soldats d'Argon sur l'île où ils vivaient.

Famille de Gladys : Sa mère est morte quand elle était jeune et son père s'est alors occupée d'elle. Elle s'est mariée à un escroc qui l'a délaissée.

Equipage du Nautilus : L'infirmière Ikorina est la petite fille du médecin de bord. Echo, le sonar, est amoureux d'elle. Il est aux côtés du chef machiniste, du timonier, du pilote principal, et du radar dans la cabine de pilotage du sous-marin, autour du capitaine Némo et de Mlle Electra. Enfin, deux membres de l'équipage sont à signaler : Mr Fate, ami de Jean, qui trouvera une fin tragique dans l'épisode 15 et le cuisinier.

Les Néo-Atlantes : On trouve les conseillers d'Argon, les supérieurs, dont le heaume est rouge, les scientifiques, habillés en blanc, les contremaîtres de la mine, et de nombreux soldats, au heaume noir.

En Afrique : On rencontre en Afrique le chef du village, Hamahama et sa promise Muramura, mais aussi Gonzalès et ses deux accompagnatrices.

Les personnages divers : Le fils de Jean et Nadia, le fils de Némo et Electra, le directeur du cirque, l'homme au guichet du cirque, le clown présentateur au cirque, le présentateur de la compétition de vol libre, la speakrine, le capitaine Melville et Mr Holland sur l'Abraham Lincoln.

Animaux : Les petits d'Attila, le chien de Marie, la baleine amie de Némo, le pingouin guide dans la base secrète...